遇到这种情况你只能问政审的负责人，看他们怎么说，我估计他们也不能做主，最终还要把你这个情况报到省委组织部。等政审的人确定怎么办之后，他们会给你通知，你按照他们的要求搞就行了。估计就像你说的补档案或者开证明，麻烦是肯定的，不过最终应该可以办好。发生了这种事，你们学校该付全责，如果政审过了就算了，如果因此过不了，你就可以直接向你们校长甚至教育部报告，让他们给你个交代。